VMD ist in der Lage, mit sehr großen Strukturen bis zu den Grenzen des verfügbaren Speichers zu arbeiten.Die 64-Bit-Versionen von VMD ermöglichen das Laden großer und zeitlich langer Simulationsverläufe in den physischen Speicher und die Aufnahme großer Volumendatensätze.Die in der Nature-Ausgabe vom 30. Mai 2013 beschriebene 64-Millionen-Atom-HIV-Kapsidsimulation ist ein erstklassiges Beispiel dafür, was mit VMD auf einer entsprechend ausgestatteten Grafik-Workstation möglich ist.Das HIV-1-Modell wurde für die Simulation unter Verwendung der Strukturerstellungstools vorbereitet, und die Skriptfunktionen von VMD wurden später für die Trajektorienanalyse verwendet.Die auf dem Nature-Cover gezeigte All-Atom-Struktur des HIV-1-Capsids wurde in VMD mithilfe der internen Tachyon-Raytracing-Engine gerendert und anschließend mit einer künstlerischen Darstellung der Virenhülle und des Nature-Cover-Texts zusammengesetzt....